В 1928 году она начала свою миссионерскую деятельность в качестве учительницы в индийском городе Калькутте. Она выполняла свою миссию собирая в трущобах бедных детей и обучая их грамоте и правилам гигиены.
В 1948 году она приняла гражданство Индии и основала организацию Миссионеры милосердия, которая в настоящее время действует через целую сеть школ, больниц, детских домов и центров питания по всему миру.
В сопровождении сотрудников Красного Креста, она отправлялась в зону боевых действий и опустошенные войной районы. В 1982 году, в разгар осады Бейрута, Мать Тереза спасла 37 находящихся в больнице детей,  ведя переговоры о прекращении огня между израильской армией и палестинскими боевиками.
Когда в конце 1980 годов Восточная Европа открылась для западного мира, она расширила свои усилия на бывшие коммунистические страны. В 1991 году мать Тереза  впервые вернулась на родину и открыла представительство ордена Братья Миссионеры милосердия дома в Тиране, Албания.

Ее отец умер в 1919 году, когда ей было восемь лет. После этого мать воспитала  ее в католической вере.  В детстве Агнес была очарована рассказами о жизни миссионеров  и уже в то время у нее созрело убеждение, что она должна посвятить свою жизнь служению людям. 
В 1928 году Агнес Гонджа Бояджиу  отправилась в аббатство Лорето, расположенное в Ратфарне, Ирландия и вступила в католический орден "Ирландские сестры Лорето", который осуществлял благотворительную деятельность в Индии. Она выбрала имя Тереза в честь Терезы де Лизье, покровительницы миссионеров и дала свои первые обеты.
В 1929 году она прибыла в Индию у и начала свою службу в качестве послушницы в Дарджилинге, недалеко от Гималайских гор. Позже она начала работать учительницей в школе для девочек Лорето, в  монастыре в восточной части Калькутты.
Откровение. Однажды Мать Тереза увидела как сын привез на тачке умирающую мать и оставил ее перед воротами больницы. Тело женщины уже разлагалось и ее не брали в больницу. Тереза помолилась,  вымыла женщину и позаботилась о ней. Женщина умерла у нее на руках с улыбкой на лице.
После этого 10 сентября 1946 года она пережила откровение и поняла, что должна покинуть орден Лорето и поселиться в трущобах Калькутты, чтобы служить несчастным и  бедным.
16 августа 1948 года мать Тереза, в возрасте 38 лет, переодевшись в купленное на рынке дешевое сари, покинула свою обитель с пятью рупиями в кармане, чтобы впоследствии основать свой Орден Милосердия.
Мать Тереза стала мировым символом любви. Она встречалась  с принцессой Дианой, Фиделем Кастро и  Рональдом Рейганом,  Дэн Сяопином,  Иоанном Павлом II и с многими другими общественными деятелями. 
Хотя в свои  последние годы Мать Тереза страдала от ухудшения болезни сердца, она продолжала служить бедным и больным, а также вести активную общественную жизнь и  выступать против разводов, контрацепции и абортов.
Она умерла 5 сентября 1997 года в возрасте 87 лет и была похоронена  в монастыре  города  Калькутта, Индия.